女神异闻录4
故事开始于2011年4月，主人公由于父母前往海外工作，而搬离原本所居住的城市，来到位于乡下的八十稻羽市的舅舅家，将在这里度过为期一年的生活。他转学到了当地的高中八十神高级中学，并很快认识了里中千枝、花村阳介、天城雪子等同班同学。而此时在八十稻羽市发生了一场离奇的杀人案件，著名女主播山野真由美以难以解释的状态死亡，凶手和手法不明。主人公的舅舅堂岛辽太郎和其部下足立透作为刑警负责调查此案。
主人公在学校里从千枝那里听闻了在八十稻羽市流传的一则都市传说，在雨夜如果一个人站在电视屏幕前，就会在电视上看到自己命中注定的对象。主人公在验证后发现了电视上的确会出现闪烁模糊的人像，以及自己将手伸向电视时，可以进入这个世界。来到学校后，主人公得知阳介和千枝都在深夜电视上看到了一个模糊的女性人像，并告知了他们自己能进入电视的事情，和阳介、千枝一起再次来到朱尼斯商场的大电视前验证时，结果阴差阳错之下三人都进入了电视，来到了一个奇特的异世界中。在这里他们发现了一个诡异的房间，并遇到了谜之生物——小熊，小熊向主人公抱怨道：有人将其他人扔进了这个世界。
次日，主人公等人得知了花村阳介仰慕的学姐小西早纪的死讯，和之前的杀人案一样，死法离奇，由于之前进入异世界的奇特经历，让阳介察觉到了神秘杀人案或许与异世界存在关联：出现在电视画面上的人就是受害者，每次现实世界起雾的时候，就会发现其遗体。为了一探究竟，主人公和阳介一同再次前往了异世界。这次在探索的过程中遭遇了暗影的袭击，主人公在困境中觉醒了人格面具的力量化解了危机。接着阳介又遇到了和自己的容貌几乎一样的暗影，暗影将阳介心中所隐藏的阴暗面毫无掩饰并加以扭曲的揭露出来。暗影说，他对学姐的死其实根本就无所谓，他只是在无聊的乡下生活因为突然发生了这种突发事件而兴奋罢了。阳介全力的否定着这些阴暗面，致使暗影发生暴走。在主人公用人格面具的力量击败了暗影后，阳介经过主人公和小熊的鼓励和劝说，也终于选择接受了自己的暗影，暗影转化为了阳介的人格面具。在这番特殊的经历下，两人意识到他们也许有办法去拯救进入电视里的人。
实际上，来到八十稻羽市的主人公因为某种原因被赋予了进入电视中的异世界的能力。主人公有时在梦境中来到天鹅绒房间，被伊格尔告知接下来前往的地方会遭遇灾难，并且被迫必须解开庞大的谜团。伊格尔和房客玛格丽特也会给主人公提供帮助，进行人格面具的合成。拥有不羁之力（Wild Card）的主人公不同于其他人——他可以同时持有复数的人格面具，并可以随意使用其中一种。而其他误入电视世界的人会遭遇自己的暗影，暗影会将本人心中的黑暗面以更加扭曲的形式展现，如果能够接受暗影，就能将其转化为自己的人格面具；如果不能接受，暗影就会发生暴走对本尊发动攻击，如果无人帮助则会导致本尊的死亡。这也是两起杀人案的被害者的死因——她们均是在电视世界中被自己的暗影袭击而死。
而随后在八十稻羽市接连发生了不知原因的失踪事件，经过确认所有失踪者都是因为某种原因而登上了电视节目的人。为了阻止凶手的计划和拯救被害者，主人公等人便前往异世界通过战斗救出被害者，第一个失踪者是与主人公同班同学，家里在当地经营旅馆的天城雪子。在救出雪子的行动中，千枝和雪子也分别面对了自己的暗影并觉醒了人格面具之力。为了解救被凶手扔进电视世界的人和找出凶手，四人组成了自称特别搜查队，并推举沉着冷静且拥有最强战斗力的主人公成为队长。
他们通过在雨夜零点观看深夜电视来锁定进入电视的目标，并采取行动进行调查，在确认其失踪并在深夜电视看到他们的暗影后便动身前往电视世界展开救援。5月到6月，特别搜查队又分别救下了声名狼藉的不良少年巽完二和人气正值火热却突然宣布休业的高中生偶像久慈川理世。他们二人以及小熊也在战斗中觉醒了人格面具的力量。因为受害人的特征变化，导致之前的推理的部分论点被否定，使众人的推理受阻。
7月，八十神高中的教师诸冈金四郎遭到了杀害，虽然被认为可能是第三起杀人案件，但他的条件与此前死亡和失踪的人们截然不符，不同于前两起杀人案的死者死因无法查明，他有明确的死因（遭钝器击打致死），并出现了疑似幕后黑手自称是真凶的阴暗少年久保美津雄。
8月，被警方羁押的久保神秘失踪，并登上了深夜电视的节目。由此，特别搜查队推断，他是为了躲避法律的制裁才逃进电视里面的。在电视世界将其击败后，特别搜查队将其抓回现实世界。久保对自己杀害了那些受害者一事供认不讳，后被逮捕。此事过后，众人一度以为事件平息。
9月，「侦探王子」白钟直斗转学进入八高。校外教学期间，特别搜查队与直斗逐渐相识。随后的9月12日夜间，「侦探王子」登上电视。第二天早晨，特别搜查队在上学的路上聚集讨论的时候，直斗因有关于那起事件的事情要告诉，所以一直在路上等着特搜队的各位，说出了关于事件的大量推断，让让众人意识到久保美津雄只是模仿犯。。此后，他为了验证真相主动上电视节目。果然，她也成为了目标，被人丢进了电视世界。在经历了异世界的战斗之后，直斗被自己的暗影爆出了身为女性的事实，直斗觉醒人格面具之力加入了特搜队。凶手还未暴露，事件仍未就此结束。
10月20日，主人公收到了第一封恐吓信。收件人是「主人公 先生」，但是，没有写寄件人的名字和地址。信上只印着一行字：「不要再继续救了」。
11月5日，主人公收到了第二封恐吓信。信上只印着一行字：「再不停手 下次就轮到 你重要的人 被送进去 杀掉咯」。这封信被堂岛辽太郎看见了，于是他当即把主人公待到了警局进行询问（半软禁半保护）。身为刑警的舅舅早在之前就敏锐的察觉到主人公与案件有所牵连，由于过于超越常识，他并不相信主人公对他所说的有关异世界的说辞，为了主人公的安全将其拘留。但这时堂岛菜菜子遭到了绑架，进入了电视世界。经过调查，堂岛家的大门是菜菜子主动打开的。由于菜菜子从来不会给陌生人开门，可见是熟人作案；因为特搜队成员自己被绑架的经历都是在门口遇到袭击，可以推断凶手携带了一台足够大的电视行动；因为从来没有人在绑架事件发生的时候发现过可疑人物，可见凶手拥有携带大型电视也不会受人注意的特点。由此，所有迹象都指向了与第一起杀人案的被害者山野真由美有婚外情的前议员生田目太郎。他受到婚外情事件的牵连丢了工作，回到老家做快递行业。他常常给镇上人送快递，可见是熟人；他送快递要用卡车，电视可以藏在车厢里面，完全不起眼。
焦急的堂岛雨夜驱车追赶他，可是却因为雨天路滑发生了车祸。生田目太郎也逃进了电视世界。堂岛只能不甘心地进了医院治疗。果然，生田目拥有进入电视世界的力量，之前完二等人的失踪也是因他所致。众人前往电视世界追捕生田目。生田目号称“一定要拯救菜菜子”，拒绝把菜菜子交给众人，化为国之狭雾与众人激战。众人好不容易击败了他，总算是救下了菜菜子。但年幼的菜菜子由于长时间被异世界中的迷雾影响，在回到现实世界后住院。
11月20日，现实世界又像往常一样起雾了。可是，这次大雾却久久未能散去。
12月3日，菜菜子的病情突然恶化。焦急的众人来到菜菜子的病房看望菜菜子，可惜菜菜子竟然因为异世界迷雾而停止了呼吸和心跳……小熊留在菜菜子的病房，其他人则怀着悲伤和愤怒前往生田目的房间。
看着想要逃跑、满脸惊恐，却一句话也答不上来的生田目，众人怒火中烧。让氛围更加压抑的是，深夜电视出现了。电视画面映射出了生田目阴暗得意的样子。一想到他可能还会继续去害人，阳介提出：如果法律不能制裁他，就由他们来制裁。团队中对于生田目的处置分成了两派：阳介、完二和直斗主张将生田目扔进电视世界自生自灭；雪子、千枝和理世则反对这么做。但阳介出于尊重主人公意愿的想法，将选择权交给了主人公。
Bad Ending 1：生田目被扔进电视，小熊离开伙伴们回到电视世界。案件也结束了。离别之日，主人公抱着谜团和遗憾离开满是迷雾的八十稻羽市。
Bad Ending 2：如果直接离开这里而不再深究下去，菜菜子会因为小熊的特殊力量奇迹般的复活。小熊会离开伙伴们回到电视世界。这个案子最后不了了之。离别之日，主人公抱着谜团和遗憾离开八十稻羽市。
而如果选择不将生田目扔进电视，继续追求真相分析疑点，菜菜子会因为小熊的特殊力量奇迹般的复活。众人在冷静下来后找到生田目了解了关于他的真相：生田目因为婚外情的曝光失去工作回到老家八十稻羽市，和主人公一样被赋予了进入电视世界的力量。一次在深夜验证都市传说时在电视里看到了山野真由美痛苦不堪的影像，忍不住伸手触摸的时候，发现了自己拥有进入电视的能力。在山野死亡后，他开始确信深夜电视是一种死亡预告。后来在深夜电视他看到了小西早纪的影像，虽然他试图说服小西注意安全，但却未能成功，将自己的发现告诉警察也不被理解。在一次深夜电视里看到雪子后他突发奇想或许电视世界里面是安全的，于是他开始行动。利用家里运输业工作的便利，他先后将雪子、完二、理世、直斗和菜菜子送进电视世界，希望在迷雾过后确认安全再带他们出来。由于菜菜子之前的每一次被送进电视的人都被主人公等人救了出来，他也因此误会自己的方法的确能拯救他人，直到菜菜子事件发生他才意识到了自己的行为反而会带来危险。他也否认了自己将山野、小西、久保三人送入电视世界。
12月5日，确认了生田目并非真凶后，将至今为止的线索和疑点堆积起来进行推理。
1. 凶手和山野真由美和小西早纪两人都有某种联结；
2. 从恐吓信的内容来看，凶手知道特搜队一直在救人，可见其完全掌握了特搜队的行动；
3. 从生田目一连串的行动看来，他不但掌握了特搜队的行动，还可能一直从旁观看；
4. 两封恐吓信都是直接丢进信箱，但是没人见到可疑人物；
5. 山野与小西的周遭，也完全没有可疑人物的目击情报，尽管警方经过地毯式排查，也一无所获。
主人公想到了一个人，那就是负责调查杀人案的刑警——足立透。足立透是熟人，很容易掌握特搜队的行动；他经常来堂岛家串门，自然可以接近堂岛家而不被怀疑；在众人推理时，他更是常常出现；警察的动态，也基本上是从他那里得知的。只不过动机不明。主人公想到平常和足立相处的种种点滴，对于要不要把怀疑他这件事告诉伙伴们，有一点犹豫了。
Bad Ending 3：主人公没有成功推理出真凶或者选择不怀疑足立透。小熊会离开伙伴们回到电视世界。主人公放弃继续追究这个案子。离别之日，主人公抱着谜团和遗憾离开八十稻羽市。
Bad Ending 4：主人公选择故意包庇足立透并且在离别之日前去拜访他。主人公帮助了足立毁灭证据，成为了他的共犯。
主人公将这个想法告诉伙伴们得到了一致认可，正巧生田目被转移的消息传来，大家对足立的怀疑度直接飙升，并前往稻羽市立医院质问足立透。医院里，足立在特搜队气势汹汹的质问下，不小心说出了“她们都是被生田目推进去”的这句话，暴露了自己是真凶的身份，随后他逃进了电视世界。
足立透和主人公、生田目太郎一样，也是被赋予了进入电视世界的能力的人，由于工作上的失误从城市被调到乡下就职的他积攒了许多的怨恨和愤怒。在一次担当山野真由美的贴身护卫时自说自话向其抱怨，遭到了对方的抵触，一时兴起的他用力推了一把山野，却意外的将其推进了电视中。足立因此发现了自己的特殊能力，并对其见死不救，导致了山野真由美的死亡。后来他找到了尸体的第一发现人小西早纪，原本是想确认她有没有注意到什么对自己不利的点，却在交谈中心生邪念被小西打了一巴掌，愤怒的他将小西推进了电视，导致了第二起命案的发生。而生田目太郎向警察局报告疑点时也是由他转接，他诱导生田目自己行动，同时又潜伏在主人公身边时不时提供一些线索，就这样特别搜查队和生田目基于相同的目的展开了行动，却又因为误会而对立。久保美津雄自称是凶手来到警局自首时，也是他为了避免生田目因为“凶手”落网而停止行动，将其推进了电视世界。这一切对他来说，就是一场“游戏”。也就是说，动机就是单纯的“为了好玩”。
后来特搜队与足立透在电视世界中的祸津稻羽镇展开了决战，足立展现了自己的人格面具——「祸津伊邪那岐」，但在特搜队的合力之下还是败下阵来。而此时制造出迷雾的元凶，天之狭雾神附身在足立身上。。为了解决雾的源头，众人合力击败了天之狭雾神，驱散了弥漫在现实世界的雾。足立也承认了自己的失败，被逮捕归案。
True Ending：[注 3]3月20日，主人公即将离开八十稻羽市之前，收到了足立的来信，信中对于「深夜电视」的源头感到质疑， 众人也对于「深夜电视」的存在和至今为止的事件感到疑惑。在回忆起自己来到镇上接触过的人们后，主人公最终找到了让自己获得进入电视力量的契机的人，而那人的真身便是「伊邪那美」，即是一切真正的元凶。众人最后一次进入电视世界，向伊邪那美发出挑战。在战斗中，由于伊邪那美的数千咒语，伙伴们全军覆没，主人公也一度倒下，但在内心听到了至今为止缔结过羁绊的人们的呼唤后，主人公重新站起来，觉醒了「伊邪那岐大神」的力量，使出 数万箴言击败了伊邪那美，将现实世界和电视世界的迷雾全部驱散。
最终主人公与伙伴们和镇上的人们告别后，乘坐火车离开了八十稻羽市。